中外共同发起微生物组测序合作计划5年内完成万种微生物模式菌株基因测序

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2018-07-0323:59:11
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中外共同发起微生物组测序合作计划5年内完成万种微生物模式菌株基因测序,全球微生物模式菌株基因组和微生物组测序合作计划正式启动该计划由中国牵头将联合12个国家的微生物资源保藏中心共同进行这是继人类基因组计划后的又一个国际性基因研究计划。

全球微生物模式菌株基因组和微生物组测序合作计划正式启动该计划由中国牵头将联合12个国家的微生物资源保藏中心共同进行这是继人类基因组计划后的又一个国际性基因研究计划10月12日,第七届世界微生物数据中心学术研讨会在北京举行。在会上,世界微生物数据中心(WDCM)和中科院微生物所牵头发起的全球微生物模式菌株基因组和微生物组测序合作计划正式启动。该计划将联合美国、德国、日本等共12个国家的微生物资源保藏中心共同进行,旨在建立一个覆盖20多个国家的微生物基因组、微生物组测序和功能挖掘合作网络。该计划的目标是在5年内完成超过10000种的微生物模式菌株基因组测序,即覆盖目前已知90%的细菌模式菌株,微生物组方面要完成1000个样本的测序,涵盖人体、环境和海洋等方向。中外共同发起微生物组测序合作计划5年内完成万种微生物模式菌株基因测序微生物组(microbiome)是指存在于特定环境中所有微生物种类及其遗传信息和功能的集合,既包括该环境中微生物间的相互作用,也包括微生物与该环境中其它物种及环境的相互作用。微生物中蕴藏着极为丰富的物种资源和基因资源,它是地球上进化历史最长、生物量最大、生物多样性最丰富的生命形式,可以影响人类健康乃至整个地球的生态循环系统。在人类微生物组计划启动之前,人类基因组计划的测序工作已经在2005年基本完成,研究在医疗、生物等领域取得了很多成果。中外共同发起微生物组测序合作计划5年内完成万种微生物模式菌株基因测序但是,科学界的许多专家发现,人类基因组提供的信息并不能完全解开影响疾病与健康的关键问题,我们还要解密人体内数量巨大的微生物菌群,这些微生物细胞的数量是人体内细胞数量的10倍,所含基因的数量更是人类基因组所含基因总和的100倍。人类微生物组计划最早由美国国立卫生研究院于2008年发起,计划用5年时间测试人类微生物变化与健康或疾病的关系,中国的多个科研机构都参与了这项计划,并一直在积极推动计划的前进。人类对于微生物基因的研究还处于早期阶段,还需要大量的数据进行支持。中外共同发起微生物组测序合作计划5年内完成万种微生物模式菌株基因测序近年来,各国都对微生物研究领域加大投入力度,也取得了很多突破,如英国华威大学的研究人员就基于云技术开发了世界最大的微生物生物信息学平台CLIMB。还有我国深圳华大基因研究院联合多家单位,基于新一代鸟枪法深度测序技术完成了对肠道微生物基因组关联分析,这是首次对结直肠腺瘤和结直肠癌肠道微生物进行研究,对结直肠腺瘤、结直肠癌的早期诊断及治疗具有重要意义。目前国际微生物资源领域最大的综合数据平台是世界微生物数据中心,该中心在2010年落户中国科学院微生物研究所,相信在这两家机构以及众多国家的联合努力下,人类微生物组计划将早日完成,并将新发现应用在健康监测、新药研发以及疫病早期诊断与治疗等方面。

Institute of Microbiology, Chinese Academy of Sciences

中国科学院微生物研究所

中国科学院微生物研究所于1958年在北京成立,是一所微生物学基础和应用研究机构,创始母机构为中国科学院。现任所长为刘双江。

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